世衛組織：不能說明問題
6月10日，世界衛生組織衛生緊急項目負責人邁克爾·瑞安表示，世衛組織會審視所有不同的研究方法，但是對已經進行的研究要謹慎作出結論。地理空間信息可以用來追蹤氣候變化、人口遷移、環境污染等，是一個有用的工具。但是不能對醫院停車場汽車數量的變化做過多解讀，然后“跳躍”兩三個步驟，得出推論，將此同新冠肺炎疫情相聯系，這個證據本身并不能說明什么問題。
瑞安表示，世衛組織閱讀、研究全球所有的相關科學信息，并進行詳盡的分析。我們查看每一個信息源，對其進行評估、驗證，審視該信息是否有助于對成員國提供更完善的公共衛生建議。對于哈佛大學團隊的此項研究，我們樂于關注，但僅限于此。因為這并不能幫助我們應對新冠肺炎疫情，對世衛組織向成員國提供最好的建議、支持成員國抗疫也沒有助益。
外交部：漏洞百出、粗制濫造
6月11日，外交部發言人回應稱，論文除了拿停車場的汽車數量來推斷新冠肺炎可能最初發生的時間之外，還有幾個明顯和低級的漏洞：
● 哈佛大學的學術平臺，只是一個開放型的、搜集和保存教研人員一些研究資料的資料庫，不是有同行評議的刊物，這個論文到底代表了哈佛大學醫學院的正式觀點和它的水準，還是只是個人的或者幾個人的運作？
● 論文的作者之一，恰巧是獨家報道這篇論文的美國廣播公司的撰稿人，而且恰巧在這篇論文甚至還沒有預發布之前就已經拿到了更多的數據并進行了報道。
● 論文當中一些圖表上標注的時間居然是2019年5月，不知道這是無心的疏忽，還是有別的問題？
● 論文認為是關鍵證據之一的，比如說咳嗽腹瀉的檢索量，我注意到中方有些媒體也做了一些深度調研，發現論文當中引述的2019年9月對咳嗽和腹瀉兩個關鍵詞的檢索量，還不如2017年和2018年同期。
發言人表示，將這么嚴肅的科學問題進行如此不嚴肅的處理，實在讓人感到奇怪。但是，這樣一個漏洞百出、粗制濫造的所謂論文，卻讓美方一些政客、媒體如獲至寶，大肆傳播，把它當成中國隱瞞疫情的新“證據”。這種可笑的現象背后的用意和操弄恐怕并不那么可笑。這是美方一些人蓄意制造和散播針對中國的虛假信息的新證據，應該遭到國際社會一致譴責和抵制。
曾光：論文荒謬、讓人不齒
國家衛健委防控新冠肺炎高級別專家組專家、中國疾病預防控制中心前流行病學首席專家曾光6月11日撰文，批評哈佛大學這篇荒謬論文讓人不齒。他指出，該論文是在把病毒起源確定為武漢的前提下做假設的，如果離開了這個前提，拿同樣方法去對全世界其他的城市做同樣的分析，特別就近分析一下美國各大城市的情況，相信會得出多得數不勝數的類似結論。即使流行病學有宏觀分析的生態學研究方法，該研究也是個典型的生態學謬誤。
百度：非常牽強、不嚴謹
6月11日，百度緊急回應：從武漢醫院附近交通車流量和百度上關于“咳嗽”與“腹瀉”的搜索數據來得出關于病毒的結論，這是非常牽強和不嚴謹的。
事實上，武漢地區“咳嗽”的整體搜索量峰值跟每年的流感季是吻合的，而“腹瀉”的搜索量與往年相比并沒有明顯變化。同時，百度指數顯示，2019年12月左右“腹瀉”搜索量還有輕微的下降。